Bei der Ö1 Kinderuni interviewen 7- bis 12-Jährige WissenschafterInnen. Mit ihren Fragen bringen die ReporterInnen die WissenschafterInnen dazu, zum Teil sehr komplizierte Themen für alle verständlich zu erklären. Dabei wird ganz unterschiedlichen Fragen nachgegangen wie zum Beispiel "Gibt es Leben im All?", "Was kann unser Gehirn"? oder "Spielen Mädchen anders als Buben?".
Georg Winckler, Rektor der Universität Wien, war 2006 der erste Wissenschafter, der im Rahmen der KinderuniWien ein Interview für die Ö1 Kinderuni gab. Seit dem waren die Ö1 Kinderuni-ReporterInnen jedes Jahr bei der KinderuniWien unterwegs. Die dabei entstandenen Beiträge werden immer sonntags um 17:10 Uhr im Radio Österreich 1 ausgestrahlt.